Celogenomové sekvenování a fylogenetická analýza kmenů ptačí chřipky H5N1 odhalily výskyt nového genotypu H5N1 v České republice. Tato varianta byla poprvé identifikována v domácím malochovu slepic v Meziříčku u Moravských Budějovic a následně potvrzena také v komerčním velkochovu kachen ve Valdíkově.
Z genetického hlediska se jedná o hybrid mezi aktuálně dominantním genotypem DI.2.1 a neznámým nízce patogenním virem ptačí chřipky, a to v poměru 7:1. Nový genotyp si zachoval vysokou patogenitu a současně získal nový genomový segment (PB2). Tento segment obsahuje významnou mutaci E627K, která je spojována se zvýšeným zoonotickým potenciálem, včetně schopnosti infikovat savce. Genotyp DI cirkuluje v Evropě ve stabilní podobě již od sezóny 2023–2024. Popsaný případ představuje první nově vzniklý genotyp odvozený od genotypu DI. Nález byl potvrzen evropskou referenční laboratoří. Vzhledem k nízké prevalenci nebyl tomuto genotypu přidělen oficiální název.
Celogenomové sekvenování a fylogenetická analýza kmenů H5N1 z většiny ohnisek (asi 70 %) ukázaly, že v sezóně 2025–2026 v celé Evropě jednoznačně převažuje jediný genotyp H5N1 označený DI.2.1. Tento genotyp se vyvíjí již od sezóny 2023–2024, kdy byl znám jako DI. V sezóně 2024–2025 se rozdělil na novou linii DI.2, z níž vznikla současná linie DI.2.1. Data také ukazují, že ohniska v malochovech a ve velkochovech vznikají většinou nezávisle. V rámci komerčních velkochovů však dochází k přenosu nákazy mezi jednotlivými hospodářstvími.
