Cirkulace viru ptačí chřipky v ČR

Nákaza H5Nx HPAI se zpravidla objevila vždy na podzim (říjen-prosinec), následně se tyto nově introdukované kmeny šířily Evropou ve formě nákazové vlny, jejíž intenzita se od jara následujícího kalendářního roku (duben-červen) začala obvykle snižovat. Během léta kmeny H5Nx zcela vymizely nebo byly detekovány velice sporadicky. Další vlna byla způsobena četnými invazemi kmenů H5Nx HPAI pocházejících mimo Evropu. Tyto kmeny vykazovaly v závislosti na sezóně širokou geografickou rozmanitost, sahající od Ruska přes Blízký východ až po Afriku.

Nicméně od léta 2021 dochází k změně v paradigmatu infekční dynamiky H5N1 HPAI na území Evropy, kdy se epizooticky probíhající nákaza mění na nákazu enzootickou. To znamená, že virus permanentně přežívá v evropské populaci divokého ptactva, které se potenciálně stává kontinuálním zdrojem nákazy. Infekční vlna po této ekologické změně byla nejzávažnější, jaká kdy byla v Evropě zaznamenaná, a to ve smyslu geografického rozšíření i počtu zlikvidované drůbeže. Rezidentní kmeny mohou být důležitým paralelním nebo dokonce výlučným zdrojem viru H5N1 pro další sezónu. To představuje zcela nový rozměr rizika pro chovanou drůbež.

Na oddělení molekulární biologie SVÚ Praha se věnujeme sledování cirkulaci viru H5Nx na území ČR, a to již od jeho prvního výskytu v roce 2006, analyzujeme jeho genetické varianty, sledujeme vztahy mezi jednotlivými ohnisky nákazy a určujeme příbuznost k dalším evropským ohniskům. Genomické sekvence zadáváme do mezinárodní databáze a naše výsledky jsou podkladem pro pravidelné reporty Evropské referenční laboratoře.

Seznam publikací z naší odborné činnosti:

Nagy A, Černíková L, Sedlák K. Genetic data and meteorological conditions: unravelling the windborne transmission of H5N1 high-pathogenicity avian influenza between commercial poultry outbreaks. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.02.12.637829v1

Fusaro A, Zecchin B, Giussani E, Palumbo E, Agüero-García M, Bachofen C, Bálint Á, Banihashem F, Banyard AC, Beerens N, Bourg M, Briand FX, Bröjer C, Brown IH, Brugger B, Byrne AMP, Cana A, Christodoulou V, Dirbakova Z, Fagulha T, Fouchier RAM, Garza-Cuartero L, Georgiades G, Gjerset B, Grasland B, Groza O, Harder T, Henriques AM, Hjulsager CK, Ivanova E, Janeliunas Z, Krivko L, Lemon K, Liang Y, Lika A, Malik P, McMenamy MJ, Nagy A, Nurmoja I, Onita I, Pohlmann A, Revilla-Fernández S, Sánchez-Sánchez A, Savic V, Slavec B, Smietanka K, Snoeck CJ, Steensels M, Svansson V, Swieton E, Tammiranta N, Tinak M, Van Borm S, Zohari S, Adlhoch C, Baldinelli F, Terregino C, Monne I. High pathogenic avian influenza A(H5) viruses of clade 2.3.4.4b in Europe-Why trends of virus evolution are more difficult to predict. Virus Evol. 2024 Apr 6;10(1):veae027. DOI: 10.1093/ve/veae027

Nagy A, Stará M, Černíková L, Kličková E, Horák O, Hofmannová L, Sedlák K. Enzootic Circulation, Massive Gull Mortality and Poultry Outbreaks during the 2022/2023 High-Pathogenicity Avian Influenza H5N1 Season in the Czech Republic. Viruses. 2024 Jan 31;16(2):221. DOI: 10.3390/v16020221

Nagy A, Stará M, Černíková L, Hofmannová L, Sedlák K. Genotype Diversity, Wild Bird-to-Poultry Transmissions, and Farm-to-Farm Carryover during the Spread of the Highly Pathogenic Avian Influenza H5N1 in the Czech Republic in 2021/2022. Viruses. 2023 Jan 20;15(2):293. DOI: 10.3390/v15020293

Nagy A, Černíková L, Stará M, Hofmannová L, Sedlák K. Genotype Uniformity, Wild Bird-to-Poultry Transmissions, and Farm-to-Farm Carryover during the Spread of the Highly Pathogenic Avian Influenza H5N8 in the Czech Republic in 2021. Viruses. 2022 Jun 28;14(7):1411. DOI: 10.3390/v14071411

Pohlmann A, King J, Fusaro A, Zecchin B, Banyard AC, Brown IH, Byrne AMP, Beerens N, Liang Y, Heutink R, Harders F, James J, Reid SM, Hansen RDE, Lewis NS, Hjulsager C, Larsen LE, Zohari S, Anderson K, Bröjer C, Nagy A, Savič V, van Borm S, Steensels M, Briand FX, Swieton E, Smietanka K, Grund C, Beer M, Harder T. Has Epizootic Become Enzootic? Evidence for a Fundamental Change in the Infection Dynamics of Highly Pathogenic Avian Influenza in Europe, 2021. mBio. 2022 Aug 30;13(4):e0060922. DOI: 10.1128/mbio.00609-22

Nagy A, Černíková L, Stará M. A new clade 2.3.4.4b H5N1 highly pathogenic avian influenza genotype detected in Europe in 2021. Arch Virol. 2022 Jun;167(6):1455-1459. DOI: 10.1007/s00705-022-05442-6

Nagy A, Dán Á, Černíková L, Vitásková E, Křivda V, Horníčková J, Masopust R, Sedlák K. Microevolution and independent incursions as main forces shaping H5 Hemagglutinin diversity during a H5N8/H5N5 highly pathogenic avian influenza outbreak in Czech Republic in 2017. Arch Virol. 2018 Aug;163(8):2219-2224. DOI: 10.1007/s00705-018-3833-7

Nagy A, Cerníková L, Jiřincová H, Havlíčková M, Horníčková J. Local-scale diversity and between-year "frozen evolution" of avian influenza A viruses in nature. PLoS One. 2014 Jul 30;9(7):e103053. DOI: 10.1371/journal.pone.0103053

Nagy A, Cerníková L, Křivda V, Horníčková J. Digital genotyping of avian influenza viruses of H7 subtype detected in central Europe in 2007-2011. Virus Res. 2012 May;165(2):126-33. DOI: 10.1016/j.virusres.2012.02.005

Nagy A, Vostinakova V, Pindova Z, Hornickova J, Cernikova L, Sedlak K, Mojzis M, Dirbakova Z, Machova J. Molecular and phylogenetic analysis of the H5N1 avian influenza virus caused the first highly pathogenic avian influenza outbreak in poultry in the Czech Republic in 2007. Vet Microbiol. 2009 Jan 13;133(3):257-63. DOI: 10.1016/j.vetmic.2008.07.013

Nagy A, Machova J, Hornickova J, Tomci M, Nagl I, Horyna B, Holko I. Highly pathogenic avian influenza virus subtype H5N1 in Mute swans in the Czech Republic. Vet Microbiol. 2007 Feb 25;120(1-2):9-16. DOI: 10.1016/j.vetmic.2006.10.004

Holko I, Machova J, Hornickova J, Tomci M, Nagl I, Horyna B, Nagy A. Highly pathogenic avian influenza in the Czech Republic. Vet Rec. 2006 May 27;158(21):741-2. DOI: 10.1136/vr.158.21.741-e