Celogenomové sekvenování pandemického koronaviru

27. 3. 2020

Naše laboratoř molekulární biologie se ve spolupráci s Národní referenční laboratoří pro chřipku a nechřipková respirační virová onemocnění Státního zdravotního ústavu v Praze podílela na získání kompletní sekvence nového pandemického viru SARS-CoV-2 detekovaného u jednoho z prvních českých pacientů. Celogenomová sekvence nám umožňuje hlubší analýzu cirkulujících kmenů SARS-CoV-2 a identifikaci původu. Sekvence byla zveřejněná v databázi GISAID pod označením hCoV-19/Czech Republic/951/2020. Na základě porovnání databázových sekvencí se český kmen zařadil do skupiny G, kam patří většina italských záchytů.